I dati relativi alla fauna che popola l’isola Boscone sono frammentari e poco dettagliati. Gli unici studi approfonditi hanno riguardato la popolazione di nitticora e garzetta, uccelli per i quali la LIPU nel 1995 stimava una presenza tra le 600 e le 800 coppie nidificanti. La Riserva, in ogni caso, è punto di sosta e di varie specie di uccelli migratori, tra le quali trampolieri, germani reali, rondini, e folaghe. Sono anche stati segnalati avvistamenti di rapaci diurni come il falco pescatore e il nibbio bruno.
Tra gli altri animali, invece, sono presenti varie specie di roditori, ricci, talpe, donnole, lepri e vari tipi di rane e rospi.

La superficie dell’isola ospita varie specie vegetali. In particolare, la maggior parte del territorio è ricoperta da salici (78%) e pioppi. Sono inoltre presenti farnie, carpini e olmi, oltre a diverse varietà di vegetazione spontanea erbacea ed arbustiva.

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